bioRxiv

خدمات پیش چاپ

bioRxiv (تلفظ "بایگانی زیستی" ^{[1] [2]} ) یک مخزن پیش چاپ با دسترسی آزاد برای علوم زیستی است که توسط جان اینگلیس و ریچارد سیور در نوامبر 2013 تأسیس شد. ^{[3] [4] توسط The} Cold میزبانی می شود. آزمایشگاه اسپرینگ هاربر (CSHL). ^[5]

به‌عنوان پیش‌چاپ، مقالاتی که در bioRxiv میزبانی می‌شوند، توسط همتایان بررسی نمی‌شوند (اگرچه ممکن است مقالات ارسالی در حال بررسی همتایان باشند و بررسی‌های همتا از منابع دیگر ممکن است در کنار پیش‌چاپ پست شوند). با این حال، همه ارسال‌ها تحت یک فرآیند بررسی دقیق قرار می‌گیرند که شامل بررسی‌های حفاظتی، غربالگری سرقت خودکار و ارزیابی مناسب بودن است. علاوه بر این، خوانندگان ممکن است نظرات خود را ارسال کنند.

اندازه گیری شده است که دو سوم مقالات ارسال شده در bioRxiv بعداً در مجلات معتبر منتشر می شوند. ^[6] BioRxiv و سایت خواهر آن، medRxiv ، منابع اصلی برای انتشار تحقیقات COVID-19 بوده‌اند . ^{[7] [8]}

تاریخچه

BioRxiv از مخزن arXiv الهام گرفته و قصد دارد آن را تکمیل کند ، که بیشتر بر روی ریاضیات ، فیزیک و رشته‌های مرتبط تمرکز دارد، که در سال 1991 توسط Paul Ginsparg (که در هیئت مشاوره bioRxiv نیز خدمت می‌کند) راه‌اندازی شد. هم از CSHL و هم از بنیاد Lourie پشتیبانی دریافت کرد. ^[9] بودجه اضافی از ابتکار چان زاکربرگ در آوریل 2017 تأیید شد. ^{[10] [11]}

قبل از تأسیس bioRxiv، دانشمندان زیست‌شناسی در مورد داشتن یک مخزن اختصاصی با دسترسی آزاد پیش‌چاپ اختلاف نظر داشتند . ^[3] بسیاری نگران بودند که تحقیقات خود را توسط رقبا مورد بررسی قرار دهند و ادعای خود را برای کشف از دست بدهند . با این حال، چندین متخصص ژنتیک مقالاتی را به بخش « زیست‌شناسی کمی » مخزن arXiv (که در سال 2003 راه‌اندازی شد) ارسال کرده بودند و دیگر آن نگرانی‌ها را نداشتند، زیرا می‌توانستند به پیش‌چاپ‌هایی برای حمایت از ادعای کشف خود اشاره کنند. ^{[3] [12]}

نرخ ارسال

جوسلین کایزر از ساینس گفت که در سال اول، این مخزن با میزبانی از 824 پیش چاپ، "جریان متوسط ​​اما رو به رشدی از مقالات را به خود جذب کرد." ^[13] بیش از 20000 توییت در مورد پیش چاپ های میزبانی شده توسط bioRxiv در سال 2015 ساخته شد. ^[9]

در فوریه 2016، نرخ ارسال به bioRxiv به طور پیوسته از 60 ≈ به 200 در ماه افزایش یافت. ^[9] در سال 2017، تعداد ارسال‌های ماهانه از بیش از 800 مورد در مارس ^[14] به بیش از 1000 مورد در ژوئیه ^[15] با تعداد کلی 10722 مقاله در سال 2017 افزایش یافت. ^[16]

در سال 2018، در مجموع 20000 نسخه خطی ارسال شده است که به طور متوسط ​​ماهانه 1600 مقاله ارائه می شود. ^[17]

در سال 2019، بیش از 31000 نسخه خطی ارسال شد که به طور متوسط ​​ماهانه 2600 مقاله (که در سه ماهه آخر سال 2019 به بیش از 3000 مقاله در ماه افزایش یافت). ^[18]

تعداد نسخه های خطی سالانه در سال 2020 به 38088 رسید، سپس اندکی به 40223 در سال 2021 افزایش یافت و به دنبال آن 36417 نسخه خطی در سال 2022 منتشر شد. تا 31 دسامبر 2022، تقریباً 180000 نسخه پیش چاپ پذیرفته شده است. ^[19]

فیلدها

bioRxiv پیش چاپ را در رشته های زیر می پذیرد

• رفتار و شناخت حیوانات
• بیوشیمی
• مهندسی زیستی
• بیوانفورماتیک
• بیوفیزیک
• زیست شناسی سرطان
• زیست شناسی سلولی
• آزمایشات بالینی
• زیست شناسی رشد
• اکولوژی
• اپیدمیولوژی
• زیست شناسی تکاملی
• ژنتیک
• ژنومیک
• ایمونولوژی
• میکروبیولوژی
• زیست شناسی مولکولی
• علوم اعصاب
• دیرینه شناسی
• آسیب شناسی
• فارماکولوژی و سم شناسی
• فیزیولوژی
• زیست شناسی گیاهی
• ارتباطات علمی و آموزش
• زیست شناسی مصنوعی
• زیست شناسی سیستم ها
• جانورشناسی

bioRxiv، مجلات، وبازبینی همتایان

در نتیجه محبوبیت bioRxiv، بسیاری از مجلات زیست‌شناسی سیاست‌های خود را در مورد پیش‌چاپ‌ها به‌روزرسانی کرده‌اند، ^{[9] [13]} و روشن می‌کنند که آنها پیش‌چاپ‌ها را به‌منظور قانون Ingelfinger به عنوان یک «نشر قبلی» نمی‌دانند .

ابتکار bioRxiv to Journals (B2J) به نویسندگان این امکان را می دهد که دستنوشته خود را مستقیماً از طریق bioRxiv به سیستم ارسال مجله ارسال کنند. از ماه می 2020، 177 مجله در این ابتکار شرکت کردند. ^[1]

در سال 2019، BioRxiv اجازه ارسال نظرات را در کنار نسخه‌های پیش‌چاپ، علاوه بر اجازه دادن نظرات در مورد پیش‌چاپ‌ها، آغاز کرد. بررسی ها می توانند از مجلات یا از پلتفرم هایی مانند Review Commons باشند. ^[20]

همچنین ببینید

• فهرست مخازن پیش چاپ
• ArXiv
• ChemRxiv
• MedRxiv
• PeerJ Preprints

مراجع

1. "پیشبرد اشتراک نتایج تحقیقات برای علوم زیستی". bioRxiv . بازیابی شده در 2018-12-12 .
2. سیور، ریچارد؛ رودر، تد؛ هیندل، سامانتا؛ ساسمن، لیندا؛ سیاه، کوین جان؛ آرژانتینی، جانت؛ مانوس، وین؛ انگلیس، جان آر. (6 نوامبر 2019). "bioRxiv: سرور پیش چاپ برای زیست شناسی". bioRxiv 10.1101/833400 . 
3. Callaway, Ewen (12 نوامبر 2013). «پیش‌چاپ‌ها جان می‌گیرند». طبیعت . 503 (7475): 180. Bibcode :2013Natur.503..180C. doi : 10.1038/503180a . PMID  24226869.
4. آزمایشگاه کلد اسپرینگ هاربر. پیش‌چاپ‌های bioRxiv اکنون می‌توانند مستقیماً به مجلات تحقیقاتی پیشرو ارسال شوند. PhysOrg . بازیابی شده در 2018-03-17 .
5. «درباره bioRxiv». bioRxiv . آزمایشگاه کلد اسپرینگ هاربر . بازیابی شده در 2016-09-07 .
6. ابدیل، ریچارد جی (24 آوریل 2019). "متا-پژوهش، ردیابی محبوبیت و نتایج همه پیش‌چاپ‌های bioRxiv". زندگی الکترونیکی 8 : e45133. doi : 10.7554/eLife.45133 . PMC 6510536 . PMID  31017570. S2CID  129944106. 
7. یان، وودان (14-04-2020). "کرونا ویروس نیاز علم به محدودیت سرعت را آزمایش می کند". نیویورک تایمز . ISSN  0362-4331 . بازیابی شده در 2020-05-01 .
8. کوئرت، مگی (2021-07-08). "چگونه علم در طول همه گیری فراتر از بررسی همتایان حرکت کرد". FiveThirtyEight . بازیابی شده در 2021-08-07 .
9. انگلیس، جان آر. سیور، ریچارد (12 فوریه 2016). "bioRxiv: گزارش پیشرفت". ASAPbio ​بازیابی شده در 2016-09-11 .
10. کالاوی، ایون (2017). "سرور پیش چاپ BioRxiv از Chan Zuckerberg Initiative کمک نقدی دریافت می کند." طبیعت . 545 (7652): 18. Bibcode :2017Natur.545...18C. doi : 10.1038/nature.2017.21894 . PMID  28470210.
11. قیصر، جوسلین (26 آوریل 2017). "سرور پیش چاپ BioRxiv از Chan Zuckerberg Initiative بودجه دریافت می کند." علم . doi :10.1126/science.aal1117.
12. Callaway، Ewen (31 ژوئیه 2012). "ژنتیک ها به پتانسیل arXiv توجه می کنند". طبیعت . 488 (7409): 19. Bibcode :2012Natur.488...19C. doi : 10.1038/488019a . PMID  22859182.
13. Kaiser، Jocelyn (11 نوامبر 2014). "BioRxiv در 1 سال: یک شروع امیدوار کننده". علم . بازیابی شده در 2016-09-07 .
14. «جان اینگلیس در توییتر». توییتر . بازیابی شده در 2017-03-01 .
15. انگلیس، جان (30-06-2017). "یک نقطه عطف علمی #پیش‌چاپ: اولین ماه >1000 میلی‌ثانیه @biorxivpreprint. از نویسندگان، شرکت‌های وابسته و کارکنان برای تحقق آن تشکر می‌کنیم." @JohnRInglis . بازیابی شده در 2017-07-02 .
16. «نتایج جستجو | bioRxiv». biorxiv.org . بازیابی 2018-10-22 .
17. «نتایج جستجو | bioRxiv».
18. «نتایج جستجو | bioRxiv».
19. «نتایج جستجو | bioRxiv». biorxiv.org . بازیابی شده در 2020-01-21 .
20. برینارد، جفری (10-10-2019). "به منظور افزایش شفافیت، bioRxiv شروع به ارسال نظرات همتایان خود در کنار پیش چاپ می کند." علم . انجمن آمریکایی برای پیشرفت علم (AAAS). doi :10.1126/science.aaz8160. ISSN  0036-8075. S2CID  211766434.

در ادامه مطلب

• یانسن، جاکلین (12 نوامبر 2013). «CSHL bioRxiv را راه‌اندازی می‌کند، یک سرور پیش‌چاپ آزاد و قابل استناد برای زیست‌شناسی». آزمایشگاه کلد اسپرینگ هاربر . بایگانی شده از نسخه اصلی در 20 دسامبر 2016 . بازبینی شده در 11 سپتامبر 2016 .
• قیصر، جوسلین (12 نوامبر 2013). "سرور پیش چاپ جدید با هدف پاسخ زیست شناسان به arXiv فیزیکدانان است". علم . بازیابی 2016-10-30 .
• "سرور پیش چاپ BioRxiv راه اندازی شد". اخبار کتابخانه برکلی UC . 15 نوامبر 2013 . بازیابی شده در 2016-09-11 .^{[ لینک مرده دائمی ]}
• کالاوی، ایون؛ پاول، کندال (16 فوریه 2016). "زیست شناسان اصرار کردند که یک پیش چاپ را در آغوش بگیرند". طبیعت . 530 (7590): 265. Bibcode :2016Natur.530..265C. doi : 10.1038/530265a . PMID  26887471.
• انگلیس، جان (22 سپتامبر 2016). "سرویس پیش چاپ bioRxiv" (PDF) . COASP 2016 .

لینک های خارجی

• وب سایت رسمی