stringtranslate.com

Hortaea werneckii

Hortaea werneckii یک گونه مخمر از خانواده Teratosphaeriaceae است . [1] این یک مخمر سیاه است که به دلیل تحمل هالوتلر قابل توجه آن مورد بررسی قرار گرفته است. [2] [3] در حالی که افزودن نمک به محیط برای کشت آن لازم نیست، H. werneckii می‌تواند درمحلول‌های نزدیک به NaCl اشباع رشد کند. [4] برای تأکید بر این سازگاری غیرمعمول گسترده، و برای تشخیص H. werneckii از سایر قارچ‌های هالوتولرانت، که دارای محدودیت‌های حداکثر شوری پایین‌تری هستند، برخی از نویسندگان  H. werneckii  را به عنوان «بسیار تحمل‌پذیر» توصیف می‌کنند. [4]

چندین مکانیسم تحمل نمک H. werneckii در سطح مولکولی مورد مطالعه قرار گرفته است. [4] به عنوان مثال، شناخته شده است که املاح اصلی سازگار آن عبارتند از گلیسرول ، اریتریتول ، آرابیتول ، و مانیتول . تجمع ملانین در دیواره سلولی به حفظ حداقل گلیسرول در داخل سلول کمک می کند. [3] چندین مؤلفه مسیر سیگنالینگ گلیسرول با اسمولاریته بالا (HOG) (که پاسخ به شوک اسمزی را کنترل می‌کند ) با جزئیات مورد مطالعه قرار گرفته‌اند و به نظر می‌رسد که برخی از آنها در عملکرد در مقایسه با همتایان خود در ساکارومایسس سرویزیه متفاوت هستند . [5] [6] [7] سازگاری با غلظت‌های بالای نمک نیز با تغییراتی در ترکیب چربی غشاء همراه است که عمدتاً با افزایش غیراشباع بودن اسیدهای چرب فسفولیپید همراه است. [8] [9]

H. werneckii باعث عفونت نادر سطحی و غیر تهاجمی پوستی کچلی سیاه می شود . [10] علائم معمولی، لکه‌های بدون درد، صاف، قهوه‌ای مایل به سیاه روی کف دست‌ها و کف پا هستند.

رشد H. werneckii در محیط های مایع اغلب شبیه مخمر است ، اگرچه می تواند به رشد رشته ای تبدیل شود. مکانیسم سوئیچ مشخص نیست. سلول ها به دلیل تولید ملانین قهوه ای به نظر می رسند. [3]

توالی یابی کل ژنوم H. werneckii [11] [12] یک تکثیر کل ژنوم اخیر را نشان داد ، که گمان می رود تنها تکثیر کل ژنوم گزارش شده در میان مخمرهای آسکومیستوس علاوه بر نمونه شناخته شده در دودمان ساکارومایسس سرویزیه باشد . [13] بر اساس توالی ژنوم سویه‌های اضافی، 10 تا از 12 سویه دارای ژنومی هستند که توسط چندین هیبریداسیون بین سویه‌های هاپلوئید تکثیر شده و دیپلوئیدهای پایدار تشکیل می‌دهند. به غیر از این رویدادهای هیبریداسیون، هیچ نشانه ای از تولید مثل جنسی یافت نشد. [14] در نتیجه، ژنوم H. werneckii نسبتاً بزرگ است (49.9 Mb) با 15974 ژن پیش‌بینی‌شده. [12] ژن‌هایی که ناقل‌های کاتیون‌های فلزی را رمزگذاری می‌کنند، که تصور می‌شود نقشی در تحمل هالوتولرانس دارند ، چندین تکرار ژن اضافی را در نقاط مختلف در طول تکامل خود تجربه کردند. [11]

یک منبع جفت گیری هموتالیک در همه ژنوم های توالی یافته یافت شد، اگرچه ممکن است یکی از ژن های جفت گیری در برخی از سویه ها غیرفعال شده باشد. با وجود این، تجزیه و تحلیل فیلوژنتیک و تجزیه و تحلیل عدم تعادل پیوند نشان می دهد که H. werneckii غیرجنسی است. [14]

مراجع

  1. ↑ «Hortaea werneckii». بایگانی شده از نسخه اصلی در 2009-08-21 . بازیابی 2009-08-10 .
  2. ↑ Gunde-Cimerman N, Ramos J, Plemenitas A (نوامبر 2009). "قارچ های هالودولار و هالوفیل". تحقیقات قارچ شناسی . 113 (Pt 11): 1231-41. doi :10.1016/j.mycres.2009.09.002. PMID  19747974.
  3. ^ abc Kogej T، Stein M، Volkmann M، Gorbushina AA، Galinski EA، Gunde-Cimerman N (دسامبر 2007). "سازگاری اسمزی قارچ هالوفیل Hortaea werneckii: نقش اسمولیت ها و ملانیزاسیون". میکروبیولوژی . 153 (Pt 12): 4261-73. doi : 10.1099/mic.0.2007/010751-0 . PMID  18048939.
  4. ^ abc Gostinčar C، Lenassi M، Gunde-Cimerman N، Plemenitaš A (2011). "سازگاری قارچی با غلظت بسیار بالای نمک". پیشرفت در میکروبیولوژی کاربردی 77 : 71-96. doi :10.1016/B978-0-12-387044-5.00003-0. شابک 9780123870445. PMID  22050822.
  5. ↑ ترک ام، پلمنیتاس A (نوامبر 2002). "مسیر HOG در مخمر سیاه هالوفیل Hortaea werneckii: جداسازی ژن همولوگ HOG1 و فعال سازی HwHog1p". نامه های میکروبیولوژی FEMS . 216 (2): 193-9. doi : 10.1111/j.1574-6968.2002.tb11435.x . PMID  12435502.
  6. ↑ Lenassi M، Vaupotic T، Gunde-Cimerman N، Plemenitas A (مارس 2007). "MAP کیناز HwHog1 از مخمر سیاه هالوفیل Hortaea werneckii: مقابله با تنش ها در نمک های خورشیدی". سیستم های نمکی 3 : 3. doi : 10.1186/1746-1448-3-3 . PMC 1828057 . PMID  17349032. 
  7. ↑ Fettich M، Lenassi M، Veranič P، Gunde-Cimerman N، Plemenitaš A (مه 2011). "شناسایی و خصوصیات اسمز سنسورهای فرضی، HwSho1A و HwSho1B، از مخمر سیاه بسیار مقاوم Hortaea werneckii". ژنتیک قارچ و زیست شناسی . 48 (5): 475-84. doi :10.1016/j.fgb.2011.01.011. PMID  21281727.
  8. ↑ ترک M، Méjanelle L، Sentjurc M، Grimalt JO، Gunde-Cimerman N، Plemenitas A (فوریه 2004). "تغییرات ناشی از نمک در ترکیب لیپیدی و سیالیت غشاء قارچ های ملانیزه مخمر مانند هالوفیل". اکستروموفیل ها 8 (1): 53-61. doi :10.1007/s00792-003-0360-5. PMID  15064990. S2CID  20139110.
  9. ↑ Gostincar C، Turk M، Plemenitas A، Gunde-Cimerman N (مارس 2009). "تظاهرات دلتا 9-، دلتا 12-دساتورازها و الانگاز توسط مخمر سیاه فوق العاده مقاوم به هالوتولاتور Hortaea werneckii وابسته به نمک هستند." تحقیقات مخمر FEMS . 9 (2): 247-56. doi : 10.1111/j.1567-1364.2009.00481.x . PMID  19220869.
  10. ↑ رید بی جی (ژوئیه 1998). "Exophiala werneckii باعث ایجاد کچلی سیاه در اسکاتلند". مجله درماتولوژی بریتانیا . 139 (1): 157-8. doi :10.1046/j.1365-2133.1998.02340.x. PMID  9764175. S2CID  70450832.
  11. ^ ab Lenassi M، Gostinčar C، Jackman S، Turk M، Sadowski I، Nislow C، Jones S، Birol I، Cimerman NG، Plemenitaš A (2013). «تکثیر کل ژنوم و غنی‌سازی ناقل‌های کاتیون‌های فلزی با توالی‌یابی ژنومی de novo مخمر سیاه فوق‌العاده تحمل‌پذیر Hortaea werneckii آشکار شد». PLOS ONE . 8 (8): e71328. Bibcode : 2013PLoSO...871328L. doi : 10.1371/journal.pone.0071328 . PMC 3744574 . PMID  23977017. 
  12. ^ ab Sinha S، Flibotte S، Neira M، Formby S، Plemenitaš A، Cimerman NG، Lenassi M، Gostinčar C، Stajich JE، Nislow C (ژوئیه 2017). "Hortaea werneckii: ترکیب یک ژنوم بهبود یافته با بیان ژن و ساختار کروماتین". G3 . 7 (7): 2015–2022. doi :10.1534/g3.117.040691. PMC 5499112 . PMID  28500048. 
  13. ↑ Dujon B (اوت 2015). "اصول اساسی ژنومیک مخمر، یک خاطره شخصی". تحقیقات مخمر FEMS . 15 (5): fov047. doi : 10.1093/femsyr/fov047 . PMID  26071597.
  14. ^ ab Gostinčar C، Stajich JE، Zupančič J، Zalar P، Gunde-Cimerman N (مه 2018). "شواهد ژنومی برای هیبریداسیون درون گونه ای در یک مخمر کلونال و بسیار تحمل کننده هالوتولو". BMC Genomics . 19 (1): 364. doi : 10.1186/s12864-018-4751-5 . PMC 5952469 . PMID  29764372.