stringtranslate.com

هاپلوگروه DNA میتوکندری انسان

توزیع هاپلوگروپ mtDNA انسانی معاصر، بر اساس تجزیه و تحلیل 2054 فرد از 26 جمعیت. [1] (الف) نمودارهای دایره ای روی نقشه. (ب) تعداد هاپلوگروه ها در قالب جدول. برای جزئیات جمعیت، به پروژه 1000 ژنوم #نمونه‌های ژنوم انسانی مراجعه کنید .

در ژنتیک انسانی ، هاپلوگروپ DNA میتوکندری انسان هاپلوگروهی است که با تفاوت در DNA میتوکندری انسان تعریف می شود . هاپلوگروپ ها برای نشان دادن نقاط اصلی شاخه در درخت فیلوژنتیک میتوکندری استفاده می شود. درک مسیر تکاملی دودمان زن به متخصصان ژنتیک جمعیت کمک کرده است تا میراث مادرزادی انسان‌های امروزی را به ریشه‌های انسانی در آفریقا و پس از آن گسترش در سراسر جهان ردیابی کنند.

نام حروف هاپلوگروه ها (نه فقط هاپلوگروه های DNA میتوکندری) از A تا Z است. همانطور که هاپلوگروه ها به ترتیب کشف آنها نامگذاری شدند، ترتیب الفبایی از نظر روابط ژنتیکی واقعی معنی ندارد.

زن فرضی در ریشه همه این گروه‌ها (به معنای فقط هاپلوگروه‌های DNA میتوکندری) آخرین جد مشترک مادری خطی (MRCA) برای همه انسان‌های موجود است . او را معمولا حوای میتوکندری می نامند .

سرعت جهش DNA میتوکندری به عنوان ساعت مولکولی میتوکندری شناخته می شود . این منطقه ای از تحقیقات در حال انجام است که یک مطالعه یک جهش را در هر 8000 سال گزارش می کند. [2]

فیلوژنی

درخت هاپلوگروه mtDNA و نقشه توزیع. [3] این اعداد برچسب‌های هاپلوگروهی هستند که بر اساس نام‌گذاری http://www.phylotree.org/ گزارش شده‌اند، [4] و مکان یکی از جهش‌های منتهی به هاپلوتیپ مشتق‌شده را نشان می‌دهند. (فقط یک نشانگر تعیین کننده شاخه، ترجیحاً از ناحیه کدگذاری نشان داده شده است.) ویژگی های اصلی جغرافیایی توزیع هاپلوگروپ با رنگ برجسته می شوند.
مسیر پراکندگی هاپلوگروه‌های mtDNA انسانی

این درخت فیلوژنتیک مبتنی بر Van Oven (2009) است. [4] در ژوئن 2022، یک فیلوژنی جایگزین برای هاپلوگروپ L پیشنهاد شد [5]

هاپلوگروه های اصلی mtDNA

نقشه جهانی مهاجرت انسان بر اساس هاپلوگروه های mtDNA برآورد شده است.

ماکرو هاپلوگروپ L

کلان هاپلوگروپ L پایه ای ترین هاپلوگروه های mtDNA انسانی است که همه هاپلوگروه های دیگر از آن نشات می گیرند (به ویژه از هاپلوگروه L3). بیشتر در آفریقا یافت می شود.

کلان هاپلوگروپ M

کلان هاپلوگروپ M بیشتر در آسیا و آمریکا یافت می شود. نوادگان آن هاپلوگروه M ، هاپلوگروه C ، هاپلوگروه Z ، هاپلوگروه D ، هاپلوگروه E ، هاپلوگروه G و هاپلوگروه Q هستند .

کلان هاپلوگروپ N

کلان هاپلوگروپ N بیشتر در استرالیا، قاره آمریکا و بخش هایی از آسیا یافت می شود. نوادگان آن هاپلوگروه N ، هاپلوگروه O ، هاپلوگروه A ، هاپلوگروه S ، هاپلوگروه I ، هاپلوگروه W ، هاپلوگروه X و هاپلوگروه Y و همچنین هاپلوگروه کلان R هستند.

کلان هاپلوگروپ R

ماکرو هاپلوگروپ R بیشتر در اروپا، شمال آفریقا، اقیانوس آرام و بخش هایی از آسیا و آمریکا یافت می شود. نوادگان آن هاپلوگروه R ، هاپلوگروه B ، هاپلوگروه F ، هاپلوگروه H ، هاپلوگروه V ، هاپلوگروه J ، هاپلوگروه T ، هاپلوگروه U و هاپلوگروه K هستند.

کرونولوژی

توزیع جغرافیایی

مقاله‌ای در سال 2004 نشان داد که هاپلوگروه‌های رایج در جمعیت‌های مدرن غرب آسیا، شمال آفریقا و اروپا عبارتند از: H، J، K، N1، T، U4، U5، V، X و W. [7]

هاپلوگروه های آفریقایی: L0، L1، L2، L3، L4، L5، L6، T، U5a

هاپلوگروپ های استرالیایی: M42a، M42c، M14، M15، Q، S، O، N، P. (مراجعات 1، 2، 3، 4، 5، 6)

هاپلوگروه های آسیایی: F، C، W، M، D، N، K، U، T، A، B، C، Z، U تعداد زیادی از انواع برای هر بخش

نرم افزار تحقیق

تکلیف

دوستیابی

فیلوژنی

نقشه ها

باستانی

مدرن

پایگاه های داده

باستانی

مدرن

همچنین ببینید

مراجع

  1. ↑ Rishishwar L، Jordan IK (2017). "پیامدهای تکامل انسان و مخلوط برای درمان جایگزینی میتوکندری". BMC Genomics . 18 (1): 140. doi : 10.1186/s12864-017-3539-3 . PMC  5299762 . PMID  28178941.
  2. ↑ لوگوالی، اوا لییس؛ کیویسیلد، توماس؛ مارگوس، تونو؛ ویلمز، ریچارد (2009)، اورورک، دنیس (ویرایش)، "تبیین نقص ساعت مولکولی میتوکندری انسان‌نما"، PLOS ONE ، 4 (12): e8260، Bibcode :2009PLoSO...4.8260L، doi : 10.1371/journal.pone.0008260 , PMC 2794369 , PMID  20041137 
  3. ↑ کیویسیلد تی (2015). "نسب مادر و تاریخ جمعیت از کل ژنوم میتوکندری". ژنت را بررسی کنید 6 : 3. doi : 10.1186/s13323-015-0022-2 . PMC 4367903 . PMID  25798216. 
  4. ^ ab van Oven M, Kayser M (فوریه 2009). "به روز رسانی درخت فیلوژنتیک جامع تنوع DNA میتوکندری انسان". جهش انسان . 30 (2): E386–94. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID  18853457. S2CID  27566749.
  5. ↑ Maier P، Runfeldt G، Estes R، Vilar M (2022). هاپلوگروپ میتوکندری آفریقایی L7: یک اصل و نسب انسان مادری 100000 ساله که از طریق ارزیابی مجدد و توالی یابی جدید کشف شد. طبیعت . 12 (1): 10747. Bibcode :2022NatSR..1210747M. doi : 10.1038/s41598-022-13856-0 . PMC 9232647 . PMID  35750688. S2CID  250021505.  
  6. ↑ «اصلاح برای انتخاب پاکسازی: مکمل ساعت مولکولی میتوکندری انسانی بهبودیافته» (PDF) . سلول : 82-83 [89]. 2009. بایگانی شده از نسخه اصلی (PDF) در 2009-12-29.
  7. ^ ویلمز، ریچارد؛ اوسانگا، اسین؛ میکرزی، ایلیا; Gölge، Mukaddes; Claustres, Mireille; میکالودیمیتراکیس، امانوئل ن. پاپا، کالیوپی اول. آناگنو، نیکلاس پی. چاونتره، آندره؛ مویسان، ژان پل؛ ریچارد، کریستل؛ گرچانینا، النا؛ بالانوفسکا، النا وی. رودان، پاوائو؛ پوزیرف، والری؛ استپانوف، وادیم؛ خسنوتدینوا، السا ک. گوسار، ولادیسلوا؛ بالانوفسکی، اولگ پی. پریچیچ، ماریجانا؛ باراک، لوورکا؛ گولوبنکو، ماریا؛ لونکینا، آرینا؛ لائوس، سرل؛ پنارون، اروان; پاریک، یوری؛ تولک، هله ویوی؛ ریدلا، مری؛ تامبتس، کریستینا؛ متسپالو، اِنه; کیویسیلد، توماس؛ درنکو، میروسلاوا وی. مالیارچوک، بوریس آ. روستالو، ارماس; Loogväli, Eva-Liis (1 نوامبر 2004). "یکنواختی از هم گسیخته: یک بوم کلاسیک رنگارنگ از mtDNA هاپلوگروپ H در اوراسیا". زیست شناسی مولکولی و تکامل . 21 (11): 2012–2021. doi : 10.1093/molbev/msh209 . PMID  15254257 - از طریق Academy.oup.com.
  8. ^ کاپری، میریام؛ Castellani، Gastone; فرانچسکی، کلودیو؛ لومارتیر، لورا؛ سوینی، فدریکا؛ ویانلو، داریو (12-06-2013). "HAPLOFIND: روشی جدید برای تخصیص هاپلوگروه mtDNA با توان عملیاتی بالا". جهش انسان . 34 (9): 1189-1194. doi :10.1002/humu.22356. eISSN  1098-1004.
  9. ^ بینا، رابرت؛ Kloss-Brandstätter، آنیتا؛ کروننبرگ، فلوریان؛ پاچر، دومینیک؛ شونهر، سباستین؛ اسپچت، گونتر؛ وایسنشتاینر، هانسی (19-10-2010). "HaploGrep: یک الگوریتم سریع و قابل اعتماد برای طبقه بندی خودکار هاپلوگروه های DNA میتوکندری". جهش انسانی: تنوع، انفورماتیک و بیماری . 32 (1): 25-32. doi :10.1002/humu.21382. eISSN  1098-1004.
  10. ↑ کروننبرگ، فلوریان؛ فورر، لوکاس؛ شونهر، سباستین؛ وایسنشتاینر، هانسی (23-04-2023). "Haplogrep 3 - یک پلت فرم تعاملی طبقه بندی و تجزیه و تحلیل هاپلوگروپ". تحقیقات اسیدهای نوکلئیک 51 (1): 263-268. doi :10.1093/nar/gkad284. eISSN  1362-4962. PMID  37070190.
  11. ↑ گارسیا اولیوارس، ویکتور؛ و همکاران (2021-10-15) [دریافت 04-08-2021]. "معیاری طبقه‌بندی‌کننده‌های هاپلوگروپ DNA میتوکندری انسانی از داده‌های توالی کل ژنوم و کل اگزوم". گزارش های علمی 11 (20510): 20510. doi :10.1038/s41598-021-99895-5. eISSN  2045-2322. PMC 8519921 . PMID  34654896. 
  12. ^ کیم، دونگ هان؛ کیم، کیجونگ؛ کیم، کیونگ یونگ؛ کیم، یونیونگ؛ کوون، چولهوان (23-04-2020). "Haplotracker: یک برنامه وب برای هاپلوگروه بندی ساده و دقیق میتوکندری با استفاده از قطعات کوتاه DNA". bioRxiv 10.1101/2020.04.23.057646v1 . 
  13. ^ کایسر، مانفرد؛ ون اوون، مانیس (2008-10-13). "به روز رسانی درخت فیلوژنتیک جامع تنوع DNA میتوکندری انسان". جهش انسان . 30 (2): 386-394. doi : 10.1002/humu.20921 . eISSN  1098-1004. PMID  18853457.
  14. ^ مختلف (2017-05-30). "نقشه DNA باستانی روزنبلات". آنتروژنیکا .
  15. ^ چیلنسکی، ماسیج؛ اهلر، ادوارد؛ ژوراس، آنا؛ Moravčík، Ondřej; نووتنی، جیری؛ Pačes, Jan (2018-09-24). "AmtDB: پایگاه داده ای از ژنوم های میتوکندری انسان باستان". تحقیقات اسیدهای نوکلئیک 47 (D1): 29-32. doi :10.1093/nar/gky843. eISSN  1362-4962.
  16. ^ براون، مایکل دی. کوگلنیک، آندریاس ام. لات، ماری تی. نواته، شمکانت بی. والاس، داگلاس سی (1996-01-01). "MITOMAP: پایگاه داده ژنوم میتوکندری انسان". تحقیقات اسیدهای نوکلئیک 24 (1): 177-179. doi :10.1093/nar/24.1.177. eISSN  1362-4962.

لینک های خارجی

در ویکی‌انبار رسانه‌های مربوط به هاپلوگروه‌های mtDNA انسانی وجود دارد .